Di stile secentesco il complesso nacque per volontà di quattro nobildonne che presero il velo nel 1604. Con i lavori del 1669 che inglobarono al complesso il convento di Regina Caeli, fu realizzato il chiostro di pianta quadrata e con cinque arcate per lato.
 

Nel 1611 quattro nobili napoletane, tra cui Ippolita e Caterina Ruffo, che di recente avevano preso i voti di clausura, si trasferirono nel convento di Santa Maria degli Angeli, ribattezzandolo col nome di San Giuseppe. Nel 1669 la chiesa preesistente fu abbattuta e si comincò a costruirne una nuova sotto la direzione di Dionisio Lazzari, che non portò a termine i lavori, interrotti nel 1674. La facciata venne completata agli inizi del XVIII secolo da Arcangelo Guglielmelli, che inserò il portico con la doppia scalinata in marmo e piperno. L'impianto è a croce latina con volta a cupola e due cappelloni simmetrici nel transetto. L'interno presenta una ricca decorazione barocca, il cui disegno è attribuibile allo stesso Lazzari. Gli affreschi della cupola, raffiguranti il Trionfo di San Giuseppe in Paradiso, sono opera di Francesco De Mura (1741). Quelli dei pennacchi riportano gli Evangelisti, attribuiti a Paolo De Majo. Nel cappellone di Sant'Agostino, decorato dai marmorai Bartolomeo e Pietro Ghetti su disegno di Giovan Domenico Vinaccia, si ammirano un dipinto di Luca Giordano (la Trinità) e due statue di Giuseppe Sanmartino (i Santi Pietro e Paolo, 1760-65).